Blaž Zupan

Blaž Zupan
Blaž Zupan 2.jpg
Född ( 1968-01-26 ) 26 januari 1968
Postojna , Slovenien
Nationalitet slovenska
Alma mater Universitetet i Ljubljana
Känd för Orange (mjukvara)
Utmärkelser Gyllene plaketten från universitetet i Ljubljana (2011 och 2019)
Vetenskaplig karriär
Fält artificiell intelligens , maskininlärning , datavetenskap , bioinformatik
institutioner University of Ljubljana , University of Houston , Baylor College of Medicine
Doktorand rådgivare Ivan Bratko

Blaž Zupan är en slovensk datavetare och universitetsprofessor, * 26 januari 1968, Postojna , Slovenien.

Karriär

Efter att ha avslutat Bežigrad Grammar School 1986 tog Zupan examen i datavetenskap vid universitetet i Ljubljana 1991. Därefter fick han en MS-examen i datavetenskap från University of Houston 1993 under mentorskap av prof. dr. Albert Mo Kim Cheng. 1997 tog han sin doktorsexamen i datavetenskap från universitetet i Ljubljana under mentorskap av prof. dr. Ivan Bratko . Efter att ha tillbringat två år som postdoc-forskare vid Jožef Stefan-institutet i Ljubljana, blev Zupan 1999 biträdande professor vid fakulteten för data- och informationsvetenskap vid universitetet i Ljubljana , där han 2009 blev professor. 2010 grundade Zupan Bioinformatics Laboratory som för närvarande har mer än 20 medlemmar. Under åren 2006–2008 och 2010–2012 var Zupan vice dekan för forskning och utveckling. Blaž Zupan samarbetar fortfarande med forskare i Houston , USA, där han har en position som gästprofessor vid Baylor College of Medicine . Under läsåret 2008–2009 var Zupan gästforskare vid Center for tissue engineering vid University of Pavia i Italien.

Undervisning och forskning

Blaž Zupan undervisar i artificiell intelligens , maskininlärning , datautvinning och bioinformatik vid University of Ljubljana och vid Baylor College of Medicine i Houston . Hans forskning fokuserar på konstruktiv induktion, epistasmetoder för att rekonstruera gennätverk, storskalig datafusion och algoritmer för att föreslå informativa datavisualiseringar. I Bioinformatics Laboratory som han driver vid fakulteten för data- och informationsvetenskap i Ljubljana leder han utvecklingen av maskininlärningsverktyget Orange med öppen källkod . Orange är skrivet i Python och är ett maskininlärningsverktyg med ett grafiskt användargränssnitt och utmärkta visualiseringar. Med ett lättanvänt gränssnitt och visuell programmering för konstruktion av arbetsflöden för dataanalys, siktar Orange på demokratisering av datavetenskap. Zupan är engagerad i utarbetandet av läromedel för praktiska workshops som använder Orange. Detta material inkluderar skript för populära YouTube-videor om datavetenskap, som har fått miljontals visningar. Med Orange genomförde Zupan över fyrtio praktiska workshops om introduktion till maskininlärning och datavetenskap över hela världen.

Zupan har publicerat nästan trehundra peer-review-artiklar som totalt har fått mer än elva tusen citeringar.

Zupan hade mer än tio doktorander och var rådgivare för mer än hundra grund- och doktorsavhandlingar.

Vald bibliografi

  • Blaž Zupan, Marko Bohanec, Janez Demšar, Ivan Bratko "Lärande genom att upptäcka begreppshierarkier". Artificiell intelligens 109:211–242, 1999.
  • Blaž Zupan et al. "GenePath: ett system för automatiserad konstruktion av genetiska nätverk från mutantdata". Bioinformatics 19(3):383, 2003.
  • Nancy Van Driessche et al. "Epistasanalys med globala transkriptionsfenotyper". Nature Genetics 37(5):471–477, 2005.
  • Riccardo Bellazzi, Blaž Zupan. "Predictive data mining in clinical medicine: Aktuella frågor och riktlinjer". International Journal of Medical Informatics 77(2):81–97, 2008.
  • Janez Demšar et al. "Orange: verktygslåda för datautvinning i python". The Journal of Machine Learning Research , januari 2013.
  • Marinka Žitnik, Blaž Zupan. "Datafusion genom matrisfaktorisering". IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence 37(1):41–53, 2015.
  • Marinka Žitnik, Edward E. Nam, Chris Dinh, Adam Kuspa, Gad Shaulsky i Blaž Zupan. "Genprioritering genom komprimerande datafusion och kedja". PLoS Computational Biology 11(10):e1004552, 2015.
  • Martin Stražar et al. "scOrange – Ett verktyg för praktisk träning av koncept från Single Cell Data Analytics". Bioinformatik 35(14):i4-i12, 2019.
  • Primož Godec et al. "Demokratiserad bildanalys genom visuell programmering genom integration av djupa modeller och småskalig maskininlärning". Nature Communications 10(1):4551, 2019.

Utmärkelser

Blaž Zupan fick redan i grundskolan och gymnasiet flera utmärkelser vid nationella och internationella tävlingar i matematik och biovetenskap. Därefter fick han som student vid universitetet i Ljubljana 1991 universitetets högsta studentpris för forskning (Prešeren-priset). Som MS-student vid University of Houston blev han medlem i Phi Kappa Phi . För sin doktorsavhandling fick han Jožef Stefan Golden Plaque 1999. Zupan är mottagare av Zois Award [ sl ] ( 2010), två Guldplaketter från University of Ljubljana (2011, 2019), ett Fulbright-stipendium (2013), och är sexfaldig mottagare av FRI UL Best Teacher Award (2008–2017). Res Publica, Financial Times , Visegrad Fund och Google värvade honom bland de 100 mest inflytelserika innovatörerna i Central- och Östeuropa (2016). Slovenian Academy of Engineering valde Zupan som associerad medlem 2017.

I media

  • Ali Žerdin. Val okužb v Sloveniji ni bil visok. A to najbrž pomeni, da bo daljši. . Intervju i dagstidningen Delo , Sobotna priloga, 9 maj 2020

externa länkar