Bionomia

Bionomia
Logo for Bionomia.png
Tillgänglig i engelsk
URL bionomia .net
Kommersiell Nej
Lanserades augusti 2018
Nuvarande status Aktiva

Bionomia (tidigare Bloodhound Tracker ) är en databas- och databasinmatningsverktyg som gör att namnsträngar för samlare och taxonomer som bestämmer provdata kan tilldelas den unika person som samlade in eller identifierade provet. Om personen är levande görs detta via deras ORCID iD, och om den är död, via deras Wikidata identifierare. Det löser därmed oklarheter där två eller flera samlare har liknande namn; eller där en samlare har arbetat under två namn, eller ett enda namn skrivet på två eller flera sätt. De provdata som är associerade med och används av Bionomia är de aggregerade GBIF- data.

Denna mekanism för att bidra till provdata uppstod från ett projekt som initierades av Muséum national d'histoire naturelle , Paris (MNHN) i mars 2019, och motiveras (delvis) av "den världsomspännande betydelsen av naturhistoriska samlingar, (som ) är i riskzonen eftersom de är kritiskt underfinansierade eller undervärderade. En bidragande orsak till denna uppenbara försummelse är avsaknaden av ett professionellt belöningssystem som kvantifierar och illustrerar bredden och djupet av expertis som krävs för att samla in och identifiera prover, underhålla dem, digitalisera deras etiketter , mobilisera data och förbättra dessa data eftersom fel och utelämnanden identifieras av intressenter." Det är också motiverat av det faktum att taxonomernas viktiga arbete med att identifiera exemplar i samlingar över hela världen misslyckas med att erkännas, och detta misslyckande sviker både institutioner och taxonomer. I augusti 2018 lanserades Bionomia (under namnet Bloodhound Tracker) som ett bidrag till Ebbe Nielsen Challenge .

Andra tidningar som sätter scenen, logiken och syftet med Bionomia är:

Den primära uppgiften i Bionomia är att lösa upp namnsträngarna för de olika samlare och taxonomerna som har artbestämt ett exemplar till unika människor. Efter att ha gjort detta, registret över växt- och djurexemplar som finns i GBIF-nedladdningar (permanent refererade till av DOI), tillsammans med de papper som härrör från dem, och länkade till Bionomias folkprofiler. Följaktligen kan det taxonomiska arbetet som är grundläggande för växtforskning spåras tillbaka till både innehavsinstitutionen och till taxonomisten, vilket kopplar samman institution, taxonom och den genererade vetenskapen.

Således tillåter Bionomia, genom att kvantifiera taxonomers bidrag, att deras arbete kan räknas, inte bara när det gäller antal exemplar, utan också i termer av antal vetenskapliga artiklar.

Bidrar

För att tillskriva insamlings-/identifieringsdata i Bionomia och för att se profildata för samlare/identifierare måste en person vara inloggad på Bionomias webbplats via ett ORCID-id (helst offentligt).

Samlarprofiler är som standard privata, vilket innebär att profilen för någon levande person som har bidragit till provdata som samlats av GBIF inte kan ses förrän den aktuella samlaren/identifieraren gör sin profil offentlig. En privat profil innebär att en samlares data varken är synlig eller verifierbar av andra. (Men man kan tillskriva den personen exemplar.)

När du trycker på "Hjälpattribut" för en profil visas GBIF-provposter med strängar som utgör en del av personens namn. Ibland framgår det av insamlar-/identifieringssträngen, datum, institution och i vilket land det samlades in att exemplaret ska hänföras till personen. Ofta måste dock all data som transkriberats för exemplaret undersökas, och det kan också finnas ett ganska högupplöst fotografi av själva exemplaret tillsammans med alla dess anteckningar genom åren. gör det möjligt för en att acceptera eller avvisa provet som insamlat av personen. När man undersöker exemplaret befinner man sig i själva GBIF-databasen och när man noterar ett fel är det möjligt att meddela problemet via e-post till kuratorn för den institution som tillhandahållit uppgifterna.

Exempel

Levande människor

Kevin Thieles profil på Bionomia visar till exempel att han har bestämt (identifierat) cirka 11 291 botaniska exemplar från minst 12 länder, samlat in cirka 4 797 exemplar från minst 4 länder och att 21 av dessa exemplar (identifierade eller samlade ) har använts i 10 publicerade tidningar, och att den 5 juni 2020 återstår ytterligare 6 % av exemplaren som kan ha samlats in eller inte identifierats av honom. Att trycka på fliken "Specialiteter" visar att han har samlat in 542 Myrtaceae -exemplar och 459 Poaceae -exemplar, samtidigt som han identifierar 3829 Dilleniaceae- och 2916 Rhamnaceae -exemplar. Fliken "Deponeras hos" avslöjar att exemplaren han har samlat är utspridda på 22 institutioner.

Shelley James profil visar att hon har bestämt 2836 botaniska exemplar från minst 20 länder, samlat in 3522 från 5 länder, och att 4457 av de exemplar hon har identifierat eller samlat har använts i 33 vetenskapliga artiklar, medan Stylianos Chatzimanolis (en skalbaggesystematiker) har samlat in 31 493 exemplar identifierade från minst 38 länder, 33 667 exemplar insamlade från minst 15 länder, varav 6 har använts i 3 vetenskapliga artiklar.

Tidigare samlare

Mary Ann McHard , en pionjär i västra Australien , som samlade in för Ferdinand von Mueller (och vars profil också är offentlig) ses ha samlat in minst 2072 bevarade exemplar, och dessa bidrar fortfarande till vetenskaplig kunskap med 12 av hennes exemplar som bidrar till en vetenskaplig uppsats.

Hermann Beckler , som samlade in i Australien mellan 1856 och 1862, har 3 179 bevarade exemplar insamlade av honom, några förmodas insamlade i USA (källa GBIF ), (vilket illustrerar kraften i detta projekt/webbplats i att transkriptions- och tolkningsfel görs i databasering exemplar kan uppmärksammas och korrigeras.) Åtta av hans exemplar har använts i fyra vetenskapliga publikationer.

externa länkar