Bglg-cis-reg RNA

bglG-cis-reg
Konsensus sekundär struktur och sekvenskonservering av cis-regulatoriska element av bglG/LicT operon
Identifierare
Symbol	bglG-cis-reg
Rfam	RF03530
Övriga uppgifter
RNA -typ	Cis-reg
SÅ	SO:0005836
PDB- strukturer	PDBe

Det bglG cis-regulatoriska RNA :t identifierades genom RNA-djupsekvensering av Clostridioides difficile 630 där det är beläget omedelbart uppströms genen bglG2. BglG2 är ett antiterminatorprotein som är involverat i regleringen av gener i beta-glukosid-fosfotransferassystemet i. Homologer av elementet C. difficile hittades över Clostridiales och andra Bacillota . Elementet är konsekvent lokaliserat 5' om bglG2 eller LicT, en annan antiterminator av beta-glukosidfosfotransferassystemet [2], i överensstämmelse med en cis-regelbunden funktion vid dessa operoner. Endast Clostridiales-sekvenser inkluderades i fröuppställningen. Sekvensen heter S0591 i ref.

externa länkar

• Sida för bglG cis regulatoriskt RNA vid Rfam