Barriär-till-autointegrationsfaktor
BAF | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identifierare | |||||||||
Symbol | BAF | ||||||||
Pfam | PF02961 | ||||||||
InterPro | IPR004122 | ||||||||
SCOP2 | 1qck / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
|
Inom molekylärbiologi är barriär-till-autointegrationsfaktor (BAF) en familj av essentiella proteiner som är mycket konserverade i metazoanevolution , och som kan fungera som DNA-bryggande proteiner. BAF binder direkt till dubbelsträngat DNA, till transkriptionsaktivatorer och till inre kärnmembranproteiner , inklusive lamin A- filament som förankrar nukleära porkomplex på plats, och nukleära LEM-domänproteiner som binder till lamininfilament och kromatin . Nya fynd tyder på att BAF har strukturella roller i kärnkraftssammansättning och kromatinorganisation, undertrycker genuttryck och kan länka samman kromatinstruktur, kärnarkitektur och genreglering i metazoer.
BAF kan utnyttjas av retrovirus för att fungera som en värdkomponent i förintegreringskomplex, som främjar integrationen av det retrovirala DNA:t i värdkromosomen genom att förhindra autointegration (integrering i sig själv). BAF kan bidra till sammansättningen eller aktiviteten av retrovirala pre-integreringskomplex genom direkt bindning till de retrovirala proteinerna p55 Gag och matris, såväl som till DNA.