Bacteroidales-1 RNA-motiv
| Bacteroidales-1 RNA | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för Bacteroidales-1 RNA
| |
| identifierare | |
| Symbol | Bacteroidales-1 |
| Rfam | RF01693 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | sRNA |
| Domän(er) | Bacteroidales |
| PDB- strukturer | PDBe |
Bacteroidales -1 RNA-motivet är en konserverad RNA- struktur identifierad av bioinformatik . Det har endast identifierats i bakterier inom ordningen (biologi) Bacteroidales . Dess förmodade längd markeras av en promotor i ena änden som överensstämmer med en alternativ konsensussekvens som är vanlig i phylum Bacteroidota , och dess 3′-ände indikeras av förutsagda transkriptionsterminatorer . Den är ofta belägen nedströms en gen som kodar för L20 ribosomala subenheten, även om det är oklart om det finns en funktionell orsak som ligger bakom denna uppenbara association.
Bacteroidales-1 RNA-motiv har rapporterats som en 6S RNA-homolog av en rapport om Bacteroides thetaiotaomicron transkriptomkarta. Förekomsten av små produkt-RNA (pRNA) som räddar sekvestrerade RNA-polymeraser , validerade 6S RNA- medierad reglering av transkriptionsaktivitet.