BART superfamilj
Bile /Arsenite/Riboflavin Transporter (BART) superfamiljen är en superfamilj av allestädes närvarande transportproteiner . Från och med början av 2016 innehåller superfamiljen sju etablerade familjer. Funktionsdata för medlemmar i alla dessa familjer finns tillgängliga. De sju familjerna finns i Transporter Classification Database med följande TC-nummer, namn och förkortningar inkluderar:
- TC# 2.A.10 - 2-Keto-3-Deoxygluconate Transporter (KdgT)-familjen
- TC# 2.A.28 - Bile Acid:Na+ Symporter-familjen (BASS)
- TC# 2.A.59 - Arsenical Resistance-3 (ACR3) familjen
- TC# 2.A.69 - Auxin Efflux Carrier (AEC)-familjen
- TC# 2.A.87 - Familjen Prokaryotic Riboflavin Transporter (P-RFT)
- TC# 9.B.33 - Sensorhistidinkinasfamiljen (SHK).
- TC# 9.B.34 - Familjen Kinas/fosfatas/cykliskt-GMP-syntas/cykliskt di-GMP-hydrolas (KPSH)
De första identifierade substraten för transportörerna inom de första 5 familjerna anges med namnen på familjerna, men alla dessa familjer transporterar en mängd andra substrat. Majoriteten av proteinmedlemmarna i de första fyra av dessa familjer uppvisar en trolig 10 transmembrannyckel (TMS) topologi som uppstod från en tandemduplicerad 5 TMS-enhet. N- och C-terminalerna tros vara i bakteriecellers cytoplasma, och detsamma kan vara sant för de flesta andra medlemmar också. Medlemmar av RFT-familjen har en 5 TMS-topologi och är homologa med var och en av de två upprepade enheterna i de 10 TMS-proteinerna. De andra två familjerna [sensorhistidinkinas (SHK) och kinas/fosfatas/syntetas/hydrolas (KPSH)] har en enda 5 TMS-enhet som föregås av en N-terminal TMS och följs av en hydrofil sensorhistidinkinasdomän (SHK-familjen) eller katalytiska domäner som liknar sensorkinas, fosfatas, cykliskt di-guanylat (GMP) syntetas och cykliskt di-GMP hydrolas katalytiska domäner, såväl som olika icke-katalytiska domäner (KPSH-familjen). Eftersom funktionella data inte är tillgängliga för transmembrandomänerna för medlemmar av SHK- och KPSH-familjerna, är det inte känt om dessa transportörliknande domäner behåller transportaktivitet eller har utvecklat exklusiva funktioner i molekylär mottagning och signalöverföring. De skulle endast kunna tjäna till att förankra de katalytiska domänerna vid membranet. Se TCDB för mer information.
