2006 års World Cup ISSF hölls i de femton olympiska skyttetävlingarna . Fyra kvalificeringsevenemang hölls i varje tävling, från mars till juni, och de bästa skyttarna kvalificerade sig till ISSF World Cup-finalen i Granada , Spanien i oktober. Det var första gången i tävlingens historia som finalerna i alla evenemang hölls på en enda plats.
Under finalen i Granada, samtidigt som hon försvarade sin titel i luftgevärstävlingen för damer, tog kinesiska Du Li världsrekordet med en perfekt poäng på 400, och blev den andra kvinnan i världen att uppnå detta för andra gången. Även i herrarnas luftgevär Thomas Farnik från Österrike ett nytt sista världsrekord med 703,1.
Alexei Klimov förbättrade världsrekordet i 25 m Rapid Fire Pistol från 589 till 591 och vann knappt efter att ha förlorat större delen av sitt övertag före finalen.
I herrarnas Trap, tjeckiska David Kostelecky motsvarade det perfekta världsrekordet på 125, men missade tre mål i finalen och förlorade så småningom mot OS- och Europamästaren Aleksei Alipov på shoot-off; båda skyttarna motsvarade också det slutliga världsrekordet.