Grupp A i Copa América 1999 var en av de tre grupperna av tävlande nationer i Copa América 1999 . Det bestod av Paraguay , Bolivia , Peru och Japan . Gruppspelet började den 29 juni och avslutades den 5 juli.
Paraguay vann gruppen och mötte Uruguay , den näst bästa tredjeplacerade, i kvartsfinalen. Peru slutade tvåa och mötte Mexiko — tvåan i grupp B — i kvartsfinalen. Bolivia och Japan slutade trea respektive fyra i gruppen och slogs ut ur turneringen.