FC Basel säsongen 1899–1900 var deras sjunde säsong sedan klubben grundades den 15 november 1893. Den här säsongen tävlade de inte om det schweiziska mästerskapet. Klubbens ordförande var Charlie Volderauer , som var ordförande mellan 1896 och 1900. Han avgick vid årsstämman och Ernst-Alfred Thalmann valdes till ny klubbordförande. FC Basel spelade sina hemmamatcher i Landhof , i Quarter Kleinbasel.
Det första nationella mästerskapet i Schweiz ägde rum 1897–98 . Detta mästerskap anses vara inofficiellt eftersom det inte organiserades av det schweiziska fotbollsförbundet (SFA; grundat 1895). FC Basel deltog inte i detta första mästerskap. Men det gjorde de i andra upplagan under förra säsongen . Basel tävlade inte i mästerskapet den här säsongen heller. Men de har deltagit i varje säsong sedan dess.
Georges Fürstenberger utsågs till lagkapten av klubbens styrelse under ordförande Charlie Volderauer . Som kapten ledde Fürstenberger lagets träningar och ansvarade för laguppställningarna. Basel spelade 16 vänskapsmatcher under säsongen, sex vann, två oavgjorda och åtta slutade med förlust. Laget gjorde 31 mål, men endast sju målskyttar är dokumenterade, och de släppte in 37 mål.
Elva av dessa vänskapsmatcher spelades hemma i Landhof , fem spelades borta. Liksom förra säsongen spelades alla vänskapsmatcher mot schweiziska lag. Bland motståndarna fanns de regerande schweiziska mästarna Anglo-American Club Zürich och Basel vann både hemmamatchen och returmatchen. De spelade också två gånger mot Zürich , men båda matcherna slutade med ett nederlag. Vidare blev det två matcher mot lokalrivalen Old Boys och båda förlorades också. De två matcherna mot FC Concordia Zürich slutade med vinst på hemmaplan men borta. De två matcherna mot Biel-Bienne slutade med en hemmaförlust, men en bortaseger.
Spelare
Obs: Flaggor indikerar landslaget enligt definitionen under FIFA:s behörighetsregler . Spelare kan ha mer än en icke-FIFA-nationalitet.
(OBS: Trots alla ansträngningar har redaktörerna för dessa böcker och författarna i "Basler Fussballarchiv" misslyckats med att kunna identifiera alla spelare, deras födelsedatum och födelseort eller datum och dödsort, som spelade i spelen under de första åren av FC Basel. Mycket dokumentation för den här säsongen saknas, de flesta målskyttar är fortfarande okända.)